Različni mikroorganizmi so prisotni v vodi, prav tako pa tudi bakterije in virusi, s katerimi se lahko okužimo. Zato so pomembni filtri za vodo.
Skozi podtalnico v pitno vodo prehajajo tudi ostanki pesticidov, zdravil in drugih kemičnih snovi. Voda je lahko onesnažena tudi zaradi fekalij ter nekaterih drugih snovi. Vse to so škodljive snovi, ki lahko povzročajo zdravstvene težave. Takšna voda zato ni pitna.
Vodovodna in komunalna podjetja te težave rešujejo tako, da vodo čistijo in ji dodajajo klor, a tudi slednji ni tako nedolžen. Prevelika izpostavljenost kloru lahko v najboljšem primeru le izsuši kožo in sluznico, bolj občutljivi ljudje pa klor težko prenašajo, saj nekaterim povzroča celo dihalne težave in močne alergijske reakcije.
